|
ساختار ژنتیکی ماهی سفید (Rutilus frissi, Nordmann, 1840) در حوضه جنوبی دریای خزر (استان گیلان) با استفاده از توالی یابی DNA میتوکندریایی
|
محمد حسن زاده صابر1*   ، امید جعفری1 ، شیرین جمشیدی1 ، محمود محسنی1 ، کیوان عباسی رنجبر2 ، سیامک باقری2 ، اسماعیل عبداله زاده1 ، مریم فروزد3 |
1-انستیتو تحقیقات بین المللی ماهیان خاویاری، موسسه تحقیقات علوم شیلاتی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج جهاد کشاورزی، رشت، ایران ، saber.merag@gmail.com
2- پژوهشکده آبزی پروری آبهای داخلی، موسسه تحقیقات علوم شیلاتی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج جهاد کشاورزی، بندر انزلی، ایران
3- موسسه تحقیقات علوم شیلاتی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج جهاد کشاورزی، رشت، ایران |
|
|
چکیده: (122 مشاهده) |
به‌منظور بررسی امکان تمایز ژنتیکی و مقایسه ساختار ژنتیک جمعیت ماهی سفید با استفاده از روش‌های تعیین توالی
DNA (DNA sequencing) ، تعداد ده عدد ماهی سفید از مناطق شرقی، مرکزی و غربی دریای خزر (سواحل استان گیلان) صید گردید. DNA سه نمونه ماهیان از هر منطقه با استفاده از روش استات آمونیوم استخراج شد و کمیت و کیفیت آن‌ها با استفاده از ژل آگارز 1 درصد و دستگاه نانودراپ (مدل ND1000) تعیین گردید. دو جفت پرایمر (Forward و Reverse) ژن 16SrRNA با استفاده از نرم افزار GeneRuner طراحی و سنتز شد. جهت تعیین توالی ژن 16SrRNA، پس از استخراج DNA و PCR، محصول PCR بر روی ژل آگارز 1 درصد رانده شد و باندهایی در محدوده 500 – 600 جفت باز برای ژن 16SrRNA تولید نمود. اختلاف تکاملی، درجه خویشاوندی و روابط فیلوژنی با استفاده از نرم افزار MEGA11 به‌دست آمد. نتایج حاصله نشان داد که نمونه‌های ماهی سفید در سه منطقه صید شده دارای 95-97 درصد شباهت بوده و 5-3 درصد با یکدیگر اختلاف تکاملی دارند. درخت فیلوژنی نمونه‌های ماهی سفید با استفاده از روش Neighbor-Joining ترسیم گردید و نشان داد که نمونه‌های مناطق غربی و شرقی هر کدام بر روی یک کلاستر مجزا قرار دارند که این می‌تواند نشانه تمایز جمعیت‌ها بر اساس ژن 16SrRNA باشد. با توجه به تخریب رودخانه‌های محل مهاجرت، آلودگی دریای خزر و عدم وجود موانع فیزیکی در این پهنه آبی، ماهی سفید در این دو منطقه هنوز از تنوع ژنتیکی برخوردار می‌باشد. بنابراین حفظ ساختار ژنتیکی جمعیت‌های ماهی سفید مناطق مرکزی، شرقی و غربی در نوار ساحلی استان گیلان دارای اهمیت اساسی می‌باشد. |
|
| واژه‌های کلیدی: ساختار ژنتیکی، ماهی سفید، دریای خزر، DNA میتوکندری. |
|
|
|
نوع مطالعه: پژوهشي |
موضوع مقاله:
تخصصي
دریافت: 1403/3/20 | پذیرش: 1403/3/21 | انتشار: 1404/4/10
|
|
|
|
|
|
|
| ارسال پیام به نویسنده مسئول |
|
|
|
| ارسال نظر درباره این مقاله |
|
|
|
