تنوع ژنتیکی ماهیان کفال طلایی (Liza aurata) موجود در سواحل جنوبی دریای خزر با استفاده از روش تعیین توالی ژن D-Loop در سواحل استان­های گیلان (انزلی) و مازندران (ساری) بررسی گردید. DNA نمونه­ها با استفاده از روش استات آمونیوم استخراج و کمیت و کیفیت آنها با استفاده از روش اسپکتروفتومتری و الکتروفورز ارزیابی گردید.  نمونه­های DNA تأیید شده،PCR  و سپس توالی­یابی شدند. توالی ناحیه­­ی D-Loop در DNA  میتوکندریایی کفال طلایی پس از ویرایش شامل 900 جفت باز (bp) بود. درجه­ی خویشاوندی  با  تست Tajima  با استفاده از نرم افزار MEGA  بین کفال ماهیان طلایی محاسبه گردید. نتایج این بررسی اختلاف ژنتیکی بالا در مناطق نمونه­­برداری را نشان می دهد. فاصله­ی ژنتیکی مشاهده شده بین مناطق نمونه­برداری 435/0 بود. همچنین میزان بالایی از Fst (615/0) بین دو منطقه  نمونه برداری مشاهده شد که این امر بیان­کننده ی تمایز بین جمعیت­های موجود می باشد. طبق نتایج حاصل از این بررسی در سواحل جنوبی دریای خزر، در دو منطقه نمونه­برداری موجود در محدوده­ی استان­های گیلان و مازندران دو جمعیت متفاوت از ماهی کفال طلایی مشاهده شد.